title: Portfolio: Microbiologie, Fermentatie & Systeem Denken
author: Evert Kervezee
tags: #portfolio, #bodemregeneratie, #mycology , #biotechnology
created: 2025-09-21
updated: status: in-progress
🧬 Portfolio: Microbiologie & Fermentatie
🔖 Overzicht
Dit portfolio documenteert mijn werk, experimenten, inzichten en leertrajecten binnen vier domeinen:
- Bodemmicrobiologie: ecologie, interacties, en toepassingen in regeneratieve landbouw. Ook wordt er gekeken naar hoe organische reststromen nuttig ingezet kunnen worden om daar bodemverbeteraars van te maken.
- Paddenstoelen kweken: voor voeding, bodemverbetering, sanering en organische reststroom verwerking.
- Precisie fermentatie: celgebaseerde productie van eiwitten, enzymen en andere biocomponenten.
- Systeem denken: Een holistische kijk op alles dat een systeem is waarbij gekeken wordt hoe de onderlinge componenten met elkaar samenhangen.
🌱 1. Bodemmicrobiologie
🔬 Onderzoeksvragen
- Hoe beïnvloeden microbiële netwerken de nutriëntenkringloop?
- Welke rol spelen schimmels en bacteriën in bodemherstel?
- Hoe krijg je effectief weer een bodemvoedselweb in de bodem?
- Hoe kun je microbiologische preparaten maken?
🧪 Experimenten & Observaties
- Compostextractanalyse (microscopie, SFW-methodiek)
- Bodemprofielmetingen (pH, EC, structuur, watervasthoudend vermogen, koolstof in de bodem)
- vrucht en gewas meting door Brix en nutriëntendichtheid te meten
- Een are behandelen met microbiologische preparaten
📚 Bronnen & Literatuur
- Soil Food Web School modules [[moc SoilFoodWeb]]
- Wetenschappelijke artikelen (gelinkt via Obsidian) [[the complexity of Nature]]
🧠 Reflectie
Wat heb ik geleerd over de complexiteit van bodemecosystemen?
Hoe kan ik deze kennis toepassen in lokale regeneratieve projecten?
- [[Horeca reststroom verwerking]] beschouwd hoe de toekomst van toekomst van organische restromen in de horeca zal zijn. Er wordt hierbij gekeken naar aankomende wetgeving om verandering teweeg te brengen. Ook kijk ik naar verschillende manieren om Organische restromen te verwerken. Denk hierbij aan wormen compost, microbiologische preparaten (SFW), biochar, Black Soldier Fly (BSF), bokashi en tenslotte precisie fermentatie.
- [[Bodemverbetering]] Waarom zou je de bodem willen verbeteren? Kort gezegd kun je stellen dat elke beschaving staat of valt met de gesteldheid van haar bodem. Een bodem vervult talloze functies voor ons als maatschappij, dat gaat voorbij alleen een goede oogst voor de boer. Een weelderige biodiversiteit, stabiel klimaat en water kwaliteit zijn gebaat bij een levende bodem.
- [[Test pilot MycoCyclo]] Dit project heeft als doelstelling om van een are (100m2) een gezonde bodem te maken. Hoe dat gedaan wordt, dat staat in het document MycoCyclo.
🍄 2. Paddenstoelen kweken
🎯 Doelen
- Voedselproductie: oesterzwammen, Blauwplaat Stropharia
- Sanering: mycoremediatie van vervuilde substraten / bodems
- Organische reststroom verwerking
🧪 Protocollen
- Agarplaat sterilisatie en inoculatie
- [[Agar]]
- [[Liquid culture]]
- [[Labprotocol]]
- Broedproductie (graan, zaagsel)
- [[grain spawn]]
- Fruiting chamber ontwerp en monitoring
- [[moc Paddenstoelen kweken]]
📊 Resultaten & Logboeken
- Succespercentages per batch
- Contaminatie-analyse
- Foto’s en microscopiebeelden (gelinkt via Obsidian Media Vault)
🧠 Reflectie
Welke parameters beïnvloeden het succes van mijn kweek?
Bij het maken van broed heb ik gekeken naar mijn slaginspercentage. Om een zo hoog mogelijke percentage te hebben, heb ik mijn eigen laminar flowhood gemaakt met hepa-filters. Het is een kast dat gemaakt is van hout en zit aan elkaar met schroefjes en ducktape. Hoewel deze kast verre van ideaal is, werkt de kast daarentegen wel degelijk. Om te bepalen of ik wel werk in zuivere lucht, meet ik het aantal particles dat in de lucht hangt met een particle counter.
Hoe kan ik workflow en hygiëne verder optimaliseren?
– ionisator
– uv-lamp
– hepa-filters in het lab
– laminar flowhood
– kweektent met hoge luchtvochtigheid, gewenste CO2 gehalte, lumière en reinheid.
🧫 3. Precisie fermentatie
🧭 Leerdoelen
- Begrip van genetisch gemodificeerde micro-organismen (GMO’s)
- Ontwerp van bioreactoren en media
- Productie van specifieke eiwitten (bijv. caseïne, insuline, enzymen)
- Scheikundige berekeningen maken
📚 Cursusmateriaal & Tools
- EdX
- [[moc biotechnology TU-Delft]]
- [[moc industrial fermentation]]
- Labprotocollen (sterilisatie, pH-regulatie, aeratie)
- Software: Obsidian
🧪 Projecten
- [ ] Simulatie van fermentatieproces (batch vs. fed-batch)
- [ ] Media-optimalisatie voor celgroei
- [ ] Documentatie van labopstelling en steriele workflow
🧠 Reflectie
Wat zijn de ethische en ecologische implicaties?
Doordat precisie fermentatie een onvermijdelijke disruptie is van de huidige vee-industrie, zal dit grote implicaties hebben voor de vee-sector. Een faillisement van deze sector is dan ook zeer waarschijnlijk. Toch biedt dit ook kansen voor de boer. De testpilot [[MycoCyclo]] kijkt dan ook naar wat mogelijk is voor de boer in de vee-sector. Verschillende verdiensten voor o.a. de bouwsector, precisie fermentatie en ecosystemen beheer zijn mogelijk.
🧭 Volgende stappen
- [ ] Certificeringstrajecten verkennen (EVC, modulaire biotech-opleidingen)
- [ ] Portfolio uitbreiden met case studies en projectresultaten
- [ ] Peer feedback verzamelen via fora of mentortrajecten
4. Systeem Denken
🧭 Leerdoelen
- Wat is denken in systemen en hoe kan ik dit toepassen op:
- ecologie
- permacultuur
- organische reststroom verwerking
- maken van microbiële preparaten
- precisie fermentatie
📚 Cursusmateriaal & Tools
- universiteit van Bergen
- WUR Sustainable Food Security: The value of systems thinking
- Thinking in Systems, Donella H. Meadows
- Principles of Systems, Jay W. Forrester
🧪 Projecten
- [[the nature of Complexity]]